Los vestigios prehistóricos más importantes encontrados en la provincia de Girona forman parte del conjunto de Arte Rupestre del Arco Mediterráneo declarado Patrimonio de la Humanidad por la UNESCO. En este sentido, cabe destacar el Centro de Interpretación de Arte Rupestre Abrics de l'Ermita, fundado en el año 2005.

  Respecto a la Edad Antigua, también fue este territorio un punto importante dentro de las rutas comerciales griegas, dejando uno de los conjuntos más valiosos de este periodo en España: Empuries. De todos modos, el primer gran desarrollo de la zona se da con los indigetes, establecidos en poblados cercanos a la costa.

  Con la invasión romana se fundó la originaria ciudad de Girona, denominada entonces Gerunda, una etimología sin aclarar, pero probablemente de origen íbero. La nueva ciudad se erigió como baluarte defensivo de la entrada de la Vía Augusta en Hispania convirtiéndose en un importante centro para toda la provincia Tarraconensis, con capital en Tarraco. Pese a que Gerunda se encontraba en el interior, disponía de una buena conexión con el puerto de Ampurias, colonizada junto al anterior asentamiento griego. La estructura de la ciudad era totalmente irregular debido a sus fines estratégicos, por lo que a finales del s.II terminó de construirse la muralla que rodeaba la ciudad.

  Las primeras huellas de la llegada del Cristianismo al territorio datan del año 304, con el primer comunicado cristiano de la ciudad de Gerunda. En el 404 ya hubo un obispado de Gerunda, según el I Concilio de Toledo, vinculado a Tarragona. Durante esta época se producen levantamientos y un cierto éxodo rural como consecuencia de la caída del Imperio Romano.

  Por su situación estratégica, la zona no sufrió gran declive con la llegada de los visigodos, que ocuparon el anterior territorio romano. Fue un punto comercial importante, con una difusión muy extensa, según los restos encontrados, de una moneda propia; la moneda gerundense. En el 517 Girona fue sede del concilio provincial.

  El territorio no ofreció gran resistencia a la invasión musulmana (hacia el 715). Sin embargo, la impronta musulmana no fue profunda, ya que, a partir del 785, la ciudad le fue entregada a Carlomagno. La época carolingia estuvo marcada por la defensa contra los ataques musulmanes y , según algunos historiadores, el inicio de la llamada Marca Hispánica. Sede del llamado Condado de Gerona, su importancia residía en su posición fronteriza.

  El territorio es conquistado por los reinos cristianos en el s.XIII, época de gran desarrollo para la comunidad judía en la capital, llegando a su decadencia en el s.XIV.

 En 1417 se inicia la construcción de la catedral, inaugurándose así la época moderna. Durante ese periodo, se vive un aumento considerable de la población con el consecuente desarrollo urbanístico, sobre todo de la capital.